Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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GBX1Q14549 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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GBX1Q14549 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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GBX1Q14549 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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GBX1Q14549 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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