Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms