Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CDH18Q13634 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CDH18Q13634 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CDH18Q13634 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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