Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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