Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms