Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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