Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms