Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPM6BQ13491 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms