Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms