Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PMS2P3Q13401 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PMS2P3Q13401 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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