Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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AP3B2Q13367 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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AP3B2Q13367 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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AP3B2Q13367 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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AP3B2Q13367 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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AP3B2Q13367 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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