Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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