Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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