Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms