Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms