Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PAX8Q06710 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms