Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms