Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms