Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms