Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED6P86452 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED6P86452 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED6P86452 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED6P86452 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED6P86452 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED6P86452 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED6P86452 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED6P86452 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms