Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO4P61968 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO4P61968 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LMO4P61968 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms