Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTBP60709 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTBP60709 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms