Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms