Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms