Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms