Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB28P51157 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB28P51157 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB28P51157 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB28P51157 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB28P51157 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB28P51157 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB28P51157 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB28P51157 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB28P51157 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms