Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLCSP50747 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLCSP50747 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLCSP50747 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms