Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBP50607 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBP50607 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBP50607 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBP50607 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms