Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTAP49354 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTAP49354 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTAP49354 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms