Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX1P48742 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX1P48742 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX1P48742 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX1P48742 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX1P48742 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX1P48742 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX1P48742 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX1P48742 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX1P48742 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms