Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms