Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms