Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms