Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBRP36941 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms