Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms