Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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HOXD13P35453 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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