Protein–RNA interactions for Protein: P31321

PRKAR1B, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1BP31321 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKAR1BP31321 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKAR1BP31321 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKAR1BP31321 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKAR1BP31321 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKAR1BP31321 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKAR1BP31321 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms