Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms