Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms