Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms