Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms