Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms