Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms