Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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