Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms