Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH1P12830 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH1P12830 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH1P12830 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH1P12830 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms