Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC172P0C7W6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms