Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI1P08151 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI1P08151 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms