Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LTAP01374 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LTAP01374 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LTAP01374 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LTAP01374 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LTAP01374 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LTAP01374 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LTAP01374 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LTAP01374 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LTAP01374 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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LTAP01374 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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LTAP01374 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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LTAP01374 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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LTAP01374 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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LTAP01374 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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LTAP01374 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LTAP01374 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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LTAP01374 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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LTAP01374 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LTAP01374 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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