Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms